1. Первым делом ищем Оригинал - лицензию или топологию.
2. Делаем папку в любом удобном месте - в Windows 7 не рекомендую выбирать для модов по умолчанию папку Program Files - система сама накладывает свои ограничения на изменения в этой папке. Обзываем латиницей, например Original SoC, устанавливаем в эту папку Оригинал ТЧ, проверяем на запуск и смотрим какой патч игры установлен.
3. Для установки разных модов могут потребоваться разные патчи Оригинала, основной игровой патч 1.0004, но могут быть моды сделанные и под более старшие патчи. Есть разные откатчики, есть патчи на официальном сайте - ищем в интернете. Здесь есть откатчик на 1.0004 с любого патча, с топологией отлично работает универсальный откатчик, откатывает и накатывает любой патч с любого - НО ОН ГЛЮЧНЫЙ, поэтому внимательно читаем тему - она небольшая, всего четыре страницы, с Серебром, говорят, не работает. У меня стоит топология и этот откатчик с тремя патчами - 1.0004, 1.0005 и 1.0006. Прежде чем установить очередной мод смотрю под какой патч он заточен и накатываю соответствующий патч на Оригинал, саму эту папку больше не трогаю. Откатчик видит только одну установленную игру - именно она и прописана в реестре, поэтому установить ещё один Оригинал отдельно и откатить уже не получится.
4. Под установку мода делаем свою папку и переименовываем также латиницей под название мода - использовать кириллицу или другие алфавиты - на собственное усмотрение. Копируем в эту папку папку со Сталкером из папки Оригинала с требуемым патчем, проверяем на запуск. Делаем ярлык на экзешник и выводим на Рабочий стол - ярлык также можно переименовать, тут можно и по-русски или как Вам понравится. Далее нужно разделить файлы с сейвами, логами и юзер-файлом от Оригинальных. В установленной в папку мода игре находим в корневой папке файл fsgame.ltx, открываем Блокнотом или любым текстовым редактором - смотрим первую строчку. В ней прописан путь для сейвов и прочих атрибутов игры - меняем название последней папки в косых скобках на название установленного мода латиницей. Запускаем с ярлыка игру в папке под мод - запустится с дефолтными настройками, настраиваем под себя - все настройки сохранятся в новом юзер-файле в новой папке которая автоматически создастся при первом запуске рядом с папкой для Оригинала - можете посмотреть по пути указанному в первой строчке файла fsgame.ltx. Всё - на этом заканчивается установка Оригинала под интересующий мод. В ярлык советую прописать ключи через пробел -nointro -noprefetch -noshadows, первый отключает вступительные ролики при запуске - устанавливаем по желанию, второй обязателен - без него часты вылеты по переполнению, третий отключает тени в игре кроме солнечных - по желанию если видеокарта не тянет. Подробнее по оптимизации можно почитать в теме Железный вопрос.
5. Теперь скачиваем все необходимые файлы для мода - ищите авторские ресурсы и скачивайте то что рекомендуют устанавливать авторы дабы потом можно было рассчитывать на тех.поддержку от авторов. Все скачанные архивы перемещаем в папку с установленной игрой - рядом со Сталкером а не в неё, если надо проверяем на контрольные суммы, там-же и распаковываем - так Вы разгрузите папку Загрузки и не будете путаться от какого мода какой архив. Также проще будет переставить мод если неправильно собрали. Обычно моды заливаются в виде заархивированной папки gamedata, которую после распаковки следует поместить в папку с игрой. Разархивируем скачанный архив и открываем папку с геймдатой мода - при архивации частенько получается что в папке геймдата находится ещё одна геймдата - поэтому открываем до игровых папок - вот эту папку геймдата в которой уже будут игровые файлы типа config, scripts и другие и копируем в папку непосредственно игры рядом с папкой bin и другими файлами. Фиксы и другие дополнения лучше копировать так: открываем папку с дополнением до игровых файлов config, scripts и др., обводим их все курсором, копируем в буфер обмена Ctrl+C, открываем геймдату мода и вставляем из буфера Ctrl+V, соглашаемся на замену предварительно поставив галочку для всех.
Таким образом ставлю какие угодно моды на ТЧ в любом количестве, удалять также просто - удаляем папку с модом, в реестре записан только Оригинал а его мы больше не трогаем.

не могу пройти подземелье Агропрома.

после того, как убиваю четырёх мародёров (из них один Аксёнов) и Стихоплёта и беру у него "бук" ничего не происходит. (судя по найденным в инете видео в этот момент должны обновиться задание и появится второй Аксёнов).
в инвентаре есть и пачка баксов и ноутбук.
переигрывал уже, раз 10 точно.
на винторез ГГ реагирует словами "Всегда мечтал о винторезе".
(Сталкеру-призраку дал "винтовку Махона", он её мне возвращает, охранника без проблем убиваю. Переигрывал, и беря его микро-Узи, и не беря.

ps. не знаю, имеет ли это какое-то значение, когда я захожу на локацию, меня встречает бюрер.
как только я убиваю его или просто достаю любое оружие и пробегаю метров 10 Шубин говорит, что я плохой и он меня не любит.
ещё раз он говорит тоже самое в проходе с большими баллонами внизу (коридор между комнатой с винтовой лестницей и коридором с химическими аномалиями).
самого Шубина нигде не видно.
(в найденном в инете видео Шубин говорит ГГ, что он хороший).

pps. (обновлено) поиск на просторах интернета показал, что причина, по видимому, в том, что я не взял у "Связного" задание на исследование подземных коммуникаций.

"Связной" ждёт в баре в вагончике рядом с подвалом Левши (по дороге в закуток "Петренко" в оригинальной игре или "Антиквара" в ТТ2).
взял у него задание, сейчас буду пробовать переиграть.